A Coordenação das Organizações Indígenas da Bacia Amazônica (COICA) é a maior organização representativa de seu tipo na região. É composta por federações nacionais indígenas eleitas em todas as nove nações amazônicas. Ao longo de sua história, a COICA esteve na linha de frente da luta pelo respeito aos direitos dos povos indígenas e pela segurança territorial. A RFUS trabalha com a COICA há muitos anos, em colaborações específicas com federações nacionais como a AIDESEP no Peru e a APA na Guiana, bem como em iniciativas regionais como o Fundo de Emergência Amazônica lançado em 2020 em resposta à pandemia de COVID-19. A COICA também é membro líder da Aliança Global de Comunidades Territoriais.
